澳门档案馆是根据1952年6月28日所颁布的第五号海外部立法条例设立，当时的名称为澳门总档案馆，隶属民政总局。1979年转属教育厅，改名历史档案馆，并正式运作。1986年拨归澳门文化学会（文化局前身）管辖至今。2016年更名为澳门档案馆。

澳门档案馆是澳门特区政府文化局的从属机构，主要职责是收集、整理、保管及保护本地区具历史价值的档案资源，并供社会大众利用。现时，馆内有档案70,000 余案卷、图像70,000 多幅、书刊资料6,000 多种，其载体以纸质为主，还包括相片、幻灯片、音像磁带、光碟和实物等。此外，档案语种以葡萄牙语居多；而馆藏最早的档案，可追溯至1630 年。

档案馆除接收政府部门移交的档案，亦接收社团及个人所捐赠的档案。澳门档案馆网站已开通在线查阅馆藏档案目录及档案文献全文影像服务。